IFISC y SARS-CoV-2

ifisc-covid

El IFISC está contribuyendo al esfuerzo mundial contra la pandemia causada por el virus SARS-CoV-2. Se presentan a continuación las actividades desarrolladas hasta la fecha (última actualización: 15/02/21).

1. Proyectos de investigación

1.1 Proyecto DISTANCIA-COVID financiado por CSIC y AENA, Coordinador del proyecto general: José J. Ramasco (IFISC) 

El proyecto analiza los efectos de las medidas de restricción de movilidad y distanciamiento social sobre la propagación de la enfermedad mediante técnicas computacionales e inteligencia artificial para el análisis masivo de datos. Participan además las siguientes instituciones: CEAB (Centro de Estudios Avanzados de Blanes), IFCA (Instituto de Física de Cantabria), IEGD (Instituto de Economía, Geografía y Demografía), CNB (Centro Nacional de Biotecnología), UPF (Universitat Pompeu Fabra), el Centro Nacional de Epidemiología y las empresas Kido Dynamics, Telefónica y ESRI. 

El proyecto es parte de la Plataforma de Salud Global COVID19 del CSIC:


1.2 Proyecto COVID-SHINE: (Understanding the spatio-temporal social determinants of health)

Proyecto financiado por “la Caixa” Banking Foundation Social Research (2021-22) IP: Joan Benach (Universitat Pompeu Fabra). IP en el IFISC: V. M. Eguíluz.


1.3 Project FACE: (FAir Computational Epidemiology)

Proyecto de construcción de una plataforma de simulación basada en datos asociada al PTI Salud Global del CSIC y financiada a través de los fondos de recuperación EUNextGeneration. Participan además las siguientes instituciones: CEAB (Center for Advanced Studies of Blanes), IFCA (Institute of Physics of Cantabria), IEGD (Institute of Economy, Geography and Demography). IP del IFISC: Jose Javier Ramasco


2. Informes y asesoramiento

2.1 Informes semanales sobre la movilidad inter e intra-provincial en España y a nivel municipal en Baleares en respuesta a las medidas de confinamiento. Estos informes son parte del proyecto DISTANCIA-COVID y han estado a disposición del Gobierno de España y del Govern de les Illes Balears.

2.2 J. J. Ramasco (IFISC) forma parte del grupo de 16 expertos de asesoramiento COVID-19 del Ministerio de Ciencia e Innovación.

Los informes de este grupo multidisciplinar se encuentran disponibles en:

2.3 Participación en los grupos de asesoramiento del Govern de les Illes Balears sobre medios digitales contra la pandemia y el de lucha contra nuevos brotes.


3. Colaboraciones sanitarias y datos sanitarios locales

3.1 Convenio con el Hospital de Son Espases (Dr. Joan Albert Pou) para el uso de registros sanitarios anonimizados de pacientes COVID. Responsable en el IFISC: Claudio Mirasso.

3.2 Registros anonimizados de urgencias del Hospital Son Llàtzer para la realización de la tesis de máster de la Sra. Laura Aviñó (2020) (Directores: Raúl Toral, Claudio Mirasso, Ángel del Río (Son Llàtzer)).


4. Recursos humanos específicos para estudios de la COVID-19

4.1 Contrato de investigador postdoctoral (2021-2022) de Juan Fernández-Gracia financiado por el Govern Balear para desarrollar el proyecto titulado FINE: Forecasting the spread and Inequalities of Epidemics. El proyecto tiene como objetivo desarrollar un modelo que contemple escalas de tiempos de días a estaciones y que incluya variables del SARS-CoV-2 de tipo i) demográfico y socioeconómico, ii) medioambiental y iii) biológico, ecológico y evolutivo. 

4.2 Contrato de investigador predoctoral de Beatriz Arregui con cargo a la Unidad de Excelencia María de Maeztu del IFISC para el desarrollo de modelos epidemiológicos. La Sra. Arregui proviene del Instituto Pierre Louis de Epidemiología y Salud Pública INSERM de París.


5. Publicaciones científicas

A flexible load sharing system optimising ICU demand in the context of COVID-19 pandemic
Lucas Lacasa, Robert Challen, Ellen Brooks-Pollock, Leon Danon
PLoS ONE 15, e0241027 (2020)

Vector-borne epidemics driven by human mobility
Soriano-Paños,David; Arias-Castro,Judy Heliana; Reyna-Lara,Adriana; Martínez,Hector J.; Meloni,Sandro; Gómez-Gardeñes,Jesús;
Physical Review Research 2, 013312 (1-12) (2020)

Risk of secondary infection waves of COVID-19 in an insular region: the case of the Balearic Islands, Spain
Eguíluz,Victor M; Fernández-Gracia,Juan; Rodríguez,Jorge P; Pericàs, Juan M; Melián, Carlos J
Frontiers in Medicine 7, 563455 (2020)

A minimal model of hospital patients’ dynamics in COVID-19
Papo,David;Righetti,Marco;Fadiga,Luciano;Biscarini,Fabio;Zanin,Massimiliano
Chaos, Solitons & Fractals 140, 110157 (2020)

Assessing functional propagation patterns in COVID-19
Zanin, Massimiliano; Papo, David
Chaos, Solitons & Fractals 138, 109993 (2020)

Travel restrictions during pandemics: A useful strategy?
Zanin, Massimiliano; Papo, David
Chaos 30, 111103 (2020)

COVID-19: Predicción de eventos de hospitalización en UCI / muerte usando registros médicos de atención y herramientas de aprendizaje automático
Khajuria, T.; Pou Goyanes, J. A.; Mirasso, C. R.; Vicente, R.
Medicina Balear 35, 25-27 (2020)

A population-based controlled experiment assessing the epidemiological impact of digital contact tracing
Rodríguez, P., Graña, S., Alvarez-León, E.E. et al.
Nature Communications 12, 587 (2021)

Loss of structural balance in stock markets
Ferreira, Eva; Orbe, Susan; Ascorbebeitia, Jone; Álvarez Pereira, Brais; Estrada, Ernesto
Scientific Reports 11, 12230 (1-10) (2021)

Anatomy of digital contact tracing: Role of age, transmission setting, adoption, and case detection
Moreno López, Jesús A.; Arregui García, Beatriz; Bentkowski, Piotr; Bioglio, Livio; Pinotti, Francesco; Boëlle, Pierre-Yves; Barrat, Alain; Colizza, Vittoria; Poletto, Chiara. 
Science Advances 7, eabd8750 (2021)

Cascading from SARS-CoV-2 to Parkinson’s Disease through Protein-Protein Interactions
Estrada, Ernesto
Viruses 13, 897 (2021)


Preprints

Impact of urban structure on COVID-19 spread
Aguilar, Javier; Bassolas, Aleix; Ghoshal, Gourab; Hazarie, Surendra; Kirkley, Alec; Mazzoli, Mattia; Meloni, Sandro; Mimar, Sayat; Nicosia, Vincenzo; Ramasco, Jose Javier; Sadilek, Adam

A comparative study between the first and second waves of COVID-19 in the Balearic Islands using machine learning on electronic health records
Khajuria, T.; Pou Goyanes, J. A.; Mirasso C.; Vicente. R. 

Effects of mobility and multi-seeding on the propagation of the COVID-19 in Spain
Mattia Mazzoli; David Mateo; Alberto Hernando; Sandro Meloni; Jose J. Ramasco


6. Divulgación y Comunicación

6.1 Publicaciones divulgativas:

6.2 Webinar sobre prevención y desescalada en el contexto de la Covid-19:

6.3 Notas de prensa:


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